是采用專利（公開技術）還是商業秘密（不公開）來保護自己的技術成果，是非常復雜的事情，國外討論這兩者關系的案例和專著都不少。

（1）如果初創公司很快要進行融資談判或有可能被大公司收購，應盡快申請專利，以證明自己的技術能力，增加談判砝碼。 

（2）選擇哪種方法和初創公司的行業（技術復雜程度，對生產工藝的要求）有很大關系，我個人的一個概括是：如果你的競爭對手看著你的專利說明書就能把產品做得和你一樣好，甚至超過你，那就需要考慮是申請專利，還是采用技術保密的方法。畢竟專利侵權訴訟費事費錢，官司還沒打贏，市場已經被對方占去了。反之，如果你的專利技術含量很高，對方想山寨也“有心無力”，那當然應該盡早申請。

（3）如果你認為你的技術是“基礎性的”，能夠影響行業格局的，能夠不斷改進的，盡早申請專利，將來可以靠把專利授權給大公司獲得利潤。 

（4）如果你的技術很容易被“反向工程”的方法破解，那還是應該申請專利，因為商業秘密的保護方法無效。此時你雖然無法實質阻止對手使用你的技術（訴訟成本太高），但持有專利總是名正言順，在產品營銷方面也有好處。 （5）“申請提交晚了，就永遠失去獲得保護的機會，因為發明一旦被公開（包括被發明人自己公開，比如使用、銷售、刊印等），在中國就不能再申請專利。特別在新產品公開之前一定要想想是否有發明值得申請專利。” 

（6）現實因素（科技型中小企業申請專項創新基金、政府補貼、園區獎勵）也很值得重視，這些錢有時也是救命的。 

總的來說，在大部分情況下還是應該盡早申請專利，雖然這在國內對建立技術壁壘的作用不是很大，但利大于弊。如果一家技術型企業連專利都沒有幾項，在和客戶談判時說服力也不夠。